Oi.

     Por padrão o tempo limite de execução de uma tarefa assíncrona em um update panel do ASP.NET Ajax é de 90 segundos.

     Caso, por um motivo ou outro, você precise aumentar este limite, faça o seguinte:

1. Localize o seu ScriptManager (o nome correto é asp:ScriptManager).
2. Adicione a propriedade ASyncPostBackTimeout e configure o seu valor em segundos. Por exemplo, asyncpostbacktimeout="300" para aumentar o timeout para 300 segundos (ou 5 minutos).

Abraços.